ATAC思路： 通过Tn5转座酶（在染色质开放区域各种切割，形成复合物后插入到靶序列）来富集开放染色质的DNA序列，PCR扩增后NGS测序。 官方一点的话：DNA转座，是一种把DNA序列从染色体的 …

康测科技为本研究提供ATAC-seq和LncRNA-seq技术服务。 通过对20对前列腺癌和邻近正常前列腺组织进行ATAC-seq来分析前列腺肿瘤发生中的染色质可及性变化。

ATAC-seq (Assay for Transposase-Accessible Chromatin using sequencing) 是分子生物学中用于评估全基因组染色质可及性的技术。 2.2 如何理解ATAC-seq

ATAC-seq 分析流程 （from Novogene） 与其他常用技术的比较： ChIP-seq：直接检测与转录因子结合的DNA序列，但 一次测序只能提供一个转录因子的信息，检出率相对较低。 DNase-seq：利 …

单细胞ATAC-seq基于10x Genomics Chromium平台，将高通量单细胞捕获与ATAC-seq技术完美结合。 ：核心是利用工程化改造的 Tn5转座酶。 该酶能特异性地识别并切割基因组中的开放染色质区域， …

求助各位大佬，最近在尝试学signac包单细胞ATAC分析，但是拿到的数据只有计数矩阵csv文件，没有fragements文件，这种情况该怎么办？

Apr 9, 2025 · 一、实验方法：黄金标准（最直接但耗时） 1. ChIP-seq（染色质免疫沉淀测序） 原理：用转录因子抗体富集其结合的DNA片段，测序后找到结合位点； 结果：直接得到TF在全基因组中的结 …

Jan 15, 2024 · 康测科技为本研究提供UMI RNA-seq和ATAC-seq技术服务。 为了阐明BRD4抑制诱导的红细胞分化机制，研究首先对DMSO和BRD4抑制剂处理的成红细胞进行RNA-seq和ATAC-seq。

结合单细胞 ATAC-seq 数据，气泡图中高表达基因的气泡位置可与染色质开放区域的细胞群分布相互印证。 总结 marker 基因气泡图 通过多维度可视化基因在不同细胞群中的表达特征，为细胞类型注释提 …

它不只是能用在转录组数据上，还能和单细胞表观组（比如ATAC-seq）、蛋白质组等数据结合起来，帮我们弄明白基因表达变化背后的表观遗传调控机制（比如染色质开放状态的变化），或者基因和蛋白 …